本人脚本如下（使用版本是1.8.9）
omiga --mode cis \
--genotype /home/abcd/sda_data/yangliuan/omiga_prepared/geno/all_chrs_plink_for_omiga \
--maf-threshold 0.05 \
--phenotype /home/abcd/sda_data/yangliuan/omiga_prepared/BZ_exp/merged_BZ_exon_counts_ENS.bed.gz \
--covariates /home/abcd/sda_data/yangliuan/omiga_prepared/factor/PC.tsv \
--pheno-group /home/abcd/sda_data/yangliuan/omiga_prepared/BZ_group/merged_BZ_exon_counts_ENS.group \
--prefix ENS \
--output-dir /home/abcd/sda_data/yangliuan/omiga_results/ENS/ \
--permutations 1000 \
--dprop-pc-covar 0.001 \
--multiple-testing acat \
--verbose --debug
报错信息如下
Error: The phenotype data is in unordered! Please sort it by chromosome and position.
已经按照chromosome and position排序了，还是会报错，不太理解unordered到底详细的意思。同时也能输出格式正确的结果，但是现在不太确定输出内容是否正确能使用。
希望得到帮助和解答，十分感谢